EdiGene与北大联合发文,于Nature Biotechnology公开前沿平台技术,助力医药研发


2018年11月5日,EdiGene科学家与北京大学魏文胜教授课题组在Nature子刊Nature Biotechnology上联合发表文章:Splicing-targeting Empowers Genome-scale Screen of Functional Long Noncoding RNAs in Human Cells。


Noncoding RNA即非编码RNA。非编码RNA在基因表达、细胞周期调节等方面发挥着重要的作用,影响着许多正常生理过程及疾病过程。然而,由于研究工具及筛选通量的限制,虽然非编码RNA基因数量远超编码基因,但其功能的研究却仅有沧海一粟。这篇文章的公开,则为非编码RNA基因的解码,以及存在于非编码RNA上的癌症、遗传性疾病治疗等相关靶点的高效筛选提供了又一强大的工具(单sg-RNA lncRNA 筛选技术)。


 (单sgRNA-lncRNA 筛选技术)


2016年,同样也是针对lnc RNA的高通量筛选,魏文胜教授课题组与哈佛大学公共卫生学院刘小乐 (Shirley Liu) 课题组合作建立了基于paired-guide RNA (pgRNA) 文库的筛选方法(双sgRNA-lncRNA 筛选技术)。该方法成功鉴定出了多个调控癌细胞生长与增殖的lncRNA,成果发表在Nature Biothechnology,在业界引起广泛关注。


 (双sgRNA-lncRNA 筛选技术)


相较于“双sgRNA-lncRNA 筛选技术”,本次EdiGene与魏文胜教授团队共同发表的lncRNA 筛选技术,将双sgRNA精简至单sgRNA,文库设计及合成更加简洁,更适合大规模筛选。同时筛选的效率及准确性也得到了进一步提升。

目前,“单sgRNA-lncRNA 筛选技术”已在癌症相关靶点筛选及全基因组水平筛选中得到了良好的应用。

(更多该技术相关信息可点击链接https://mp.weixin.qq.com/s/oi5cmJELAPFYN3caobZang?scene=25#wechat_redirect,参考北大生科新闻)



关于lncRNA

长链非编码RNA(lncRNA)指的是长度≥200nt的,不编码蛋白质的RNA。lncRNA数量巨大,各种实验检测和通过生物信息学方法预测出来的lncRNA基因,总数量远远超过编码基因的数量。其中有明确功能研究的只是沧海一粟。已经有功能研究的lncRNA主要在癌症相关的代谢通路中发挥重要作用,包括细胞增殖、细胞迁移、细胞永生、增长抑制、转移等。lncRNA的功能的实现具有多态性,复杂性。如何研究lncRNA的功能是目前生命科学研究领域的一大难题。

关于单sgRNA-lncRNA筛选技术

一种基于CRISPR的高通量遗传筛选技术,用于lncRNA的功能性筛选。该技术通过CRISPR破坏全基因组lncRNA或某个群体lncRNA的剪接位点,进行基因敲除,来建立被筛选的细胞库。基因功能的发掘过程同一般CRISPR高通量遗传筛选。

关于CRISPR-高通量基因组筛选

一种高通量的针对海量基因的功能筛选方法。通过CRISPR系统,获得不同的基因被分别敲除的细胞库。对细胞库中不同基因被敲除的细胞在某个环境下生长情况进行分析,从而推导出被敲除基因的功能。相较于基于RNAi的高通量基因功能筛选,CRISPR高通量遗传筛选数据信噪比更高,分析更容易,结果相对更加准确。

关于博雅辑因

博雅辑因(EdiGene)是专业的基因组编辑公司,致力于将前沿的基因组编辑技术转化为治病救人的良方;同时使用创新的高通量遗传筛选技术,产生功能性生物大数据,为新药开发提速。目前,EdiGene已建成GMP级别基因编辑治疗产品生产基地,为治疗产品的临床阶段做准备。同时,基于拥有大量自主知识产权的高通量基因组筛选平台,EdiGene已与多家大型药企及高校科研单位建立起合作关系。

EdiGene是国家高新技术企业,被生物技术顶级期刊Nature Biotechnology评为2017受资本青睐的十家技术密集型初创企业之一。在北京、广州及美国拥有分公司。

 

About Us


Headquarters

EdiGene Inc.

Building No.22, Kexueyuan Road, Changping Distriction, Beijing, China

Guangzhou Branch

EdiGene Guangzhou Inc.

Building 10, No.6, Nanjianger Road, Zhujiang Street, Nansha Distriction, Guangzhou, China

USA Branch

EDIGENE BIOTECHNOLOGY USA INC.

245 FIRST STREET, RIVERVIEW II, 18TH FLOORCAMBRIDGE, MA 02142 USA

Contact Us

Tel:010-8073 3899
E-mail:media@edigene.com

Leave us a message

Introduction


Profile

Founder

History

Team
Click to follow us