Pool sgRNA
CRISPR sgRNA文库是用于高通量敲除人类全基因组或特定基因类群的重要工具。通过基因敲除可实现基因功能缺失筛选,进而进行哺乳动物系统基因分析、基因功能研究、基因组级别功能研究(信号通路研究、癌症机制研究)以及发现验证药物靶点等一系列研究。

EdiGene提供基因敲除方式的高通量遗传筛选所用的CRISPR sgRNA文库,包括全人类基因组敲除文库以及基于不同功能性的基因组敲除亚文库。通过基因功能完全丧失的方式研究信号通路机制或筛选药物相关靶点等。

 

sgRNA 文库

博雅辑因可定制合成人类全基因组文库及基于不同功能或基因定位的亚文库。同时可提供后期数据分析服务,让您的高通量服务更加简单快速!
 

设计理念

我们针对在USCS hg38数据库中注明的18,513个基因构建了人类全基因敲除sgRNA文库。 所有蛋白质编码基因的靶向CDS区域均设计sgRNA,除去GC含量高于80%或低于20%的sgRNA, 只保留了靶向前50%部分CDS的sgRNA。 同时设计2000条阴性对照sgRNA, 通过John Doench等人发表的算法对候选sgRNA进行了排名。  最终的文库包含170,815个sgRNA,并根据基因位置分为10个亚文库。

优势

· 通过优化公开数据的算法,使sgRNA具有更高的基因敲除效率;

· 98.7%的基因具备6条以上sgRNA,是CRISPR筛选强有力的工具;

· 提供不同的功能性亚文库,体量更小,使用更具特异性;

文库构建流程

·可提供gRNA混合文库定制服务,包括质粒和病毒形式: 

pooled sgRNA library

 

货号

产品名称 

靶基因数量

价格

HTSLV60301

Edi-HTSTM Whole Mouse Genome Lentiviral CRISPR Library

19357

询价

HTSLV60401

Edi-HTSTM Whole Human Genome Lentiviral CRISPR Library

18823

询价

HTSLV60402

Edi-HTSTM Human Kinase Lentiviral CRISPR Library

738

询价

HTSLV60403

Edi-HTSTM Human Phosphatase Lentiviral CRISPR Library

265

询价

HTSLV60404

Edi-HTSTM Human Kinase & Phosphatase Lentiviral CRISPR Library

1003

询价

HTSLV60405

Edi-HTSTM Human Cytokine Lentiviral CRISPR Library

175

询价

HTSLV60406

Edi-HTS™ Human Kinase & Phosphotase & Plasma Membrane Lentiviral 
CRISPR Library

4255

询价

HTSLV60407

Edi-HTSTM Human Enzyme Lentiviral CRISPR Library

2948

询价

HTSLV60408

Edi-HTSTMHuman GPCR Lentiviral CRISPR Library

692

询价

HTSLV60409

Edi-HTSTM Human Growth Factor Lentiviral CRISPR Library

131

询价

HTSLV60410

Edi-HTSTM Human Ion Channel Lentiviral CRISPR Library

337

询价

HTSLV60411

Edi-HTSTM Human Ligand-dependent Nuclear Receptor Lentiviral CRISPR Library

46

询价

HTSLV60412

Edi-HTSTM Human Peptidase Lentiviral CRISPR Library

530

询价

HTSLV60413

Edi-HTSTM Human Transcription Regulator Lentiviral
CRISPR Library

1515

询价

HTSLV60414

Edi-HISTM Human Translation Regulator Lentiviral CRISPR
Library

103

询价

HTSLV60415

HEdi-HTSTM Human Transmembrane Receptor Lentiviral
CRISPR Library

354

询价

HTSLV60416

Edi-HTSTM Human Transporter Lentiviral CRISPR Library

1033

询价

HTSLV60417

Edi-HTSTM Human Deubiquitin Lentiviral CRISPR Library

 

询价

HTSLV60418

Edi-HTSTM Human Ubiquitin Lentiviral CRISPR Library

438

询价

HTSLV60419

Edi-HTSTM Human Epigenetics Lentiviral CRISPR Library

209

询价

HTSLV60420

HEdi-HTSTM Human Druggable Target Lentiviral CRISPR Library

2897

询价

 

LncRNA 文库

真核基因组包含蛋白质编码区和非编码区。转录组分析显示,高达90%的人类基因组转录为非编码RNA。非编码RNA根据其大小进一步细分为小的非编码RNA(<200nt)和长非编码RNA。 lncRNA与不同的分子和细胞功能相关,并与癌症,发育和疾病有关。然而,大多数这些新鉴定的lncRNA的细胞功能尚未阐明。此外,lncRNA可能通过不同的机制,包括染色质修饰,转录,转录后转录,与RNA结合蛋白的相互作用,转录因子的共激活和启动子的抑制等因素在基因调控中起重要作用。基于其专有的配对gRNA(pgRNA)库设计策略,EdiGene已经构建了靶向约700个lncRNAs的pgRNA文库,这将使研究人员能够识别癌症中IncRNAs的分子功能

 

相关参考文献

  1. Zhou Y, et al. (2014) High-throughput screening of a CRISPR/Cas9 library for functional genomics in human cells. Nature 509 : 487.

  2. Peng J, et al. (2015) High-throughput screens in mammalian cells using the CRISPR-Cas9 system. FEBS J. 282 : 2089.

  3. Zhu S, et al. (2016) Genome-scale deletion screening of human long non-coding RNAs using a paired-guide RNA CRISPR–Cas9 library. Nat. Biotechnol. 34 : 1279.